Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGRPO00253 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGRPO00253 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AGRPO00253 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AGRPO00253 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AGRPO00253 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGRPO00253 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGRPO00253 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AGRPO00253 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGRPO00253 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGRPO00253 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGRPO00253 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGRPO00253 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGRPO00253 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGRPO00253 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGRPO00253 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGRPO00253 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGRPO00253 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGRPO00253 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGRPO00253 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGRPO00253 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGRPO00253 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGRPO00253 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGRPO00253 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGRPO00253 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGRPO00253 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGRPO00253 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AGRPO00253 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGRPO00253 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGRPO00253 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGRPO00253 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGRPO00253 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGRPO00253 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGRPO00253 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGRPO00253 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGRPO00253 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGRPO00253 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGRPO00253 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGRPO00253 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGRPO00253 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGRPO00253 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGRPO00253 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGRPO00253 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGRPO00253 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGRPO00253 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGRPO00253 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGRPO00253 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGRPO00253 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
AGRPO00253 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGRPO00253 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGRPO00253 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGRPO00253 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGRPO00253 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGRPO00253 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGRPO00253 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AGRPO00253 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGRPO00253 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGRPO00253 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGRPO00253 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGRPO00253 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGRPO00253 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AGRPO00253 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGRPO00253 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGRPO00253 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGRPO00253 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGRPO00253 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGRPO00253 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGRPO00253 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGRPO00253 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGRPO00253 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGRPO00253 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGRPO00253 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGRPO00253 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGRPO00253 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGRPO00253 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGRPO00253 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGRPO00253 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGRPO00253 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGRPO00253 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGRPO00253 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGRPO00253 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AGRPO00253 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGRPO00253 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGRPO00253 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGRPO00253 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGRPO00253 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGRPO00253 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGRPO00253 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGRPO00253 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGRPO00253 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGRPO00253 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGRPO00253 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGRPO00253 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGRPO00253 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGRPO00253 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AGRPO00253 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AGRPO00253 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGRPO00253 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGRPO00253 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGRPO00253 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms