Protein–RNA interactions for Protein: K7EIQ3

ZNF561-AS1, Uncharacterized protein ZNF561-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF561-AS1K7EIQ3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms