Protein–RNA interactions for Protein: J3QT63

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QT63 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QT63 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QT63 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QT63 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QT63 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QT63 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QT63 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QT63 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QT63 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QT63 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QT63 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QT63 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QT63 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QT63 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QT63 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QT63 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QT63 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QT63 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QT63 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QT63 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QT63 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QT63 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QT63 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QT63 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QT63 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QT63 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QT63 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QT63 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QT63 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QT63 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QT63 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QT63 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QT63 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QT63 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QT63 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QT63 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QT63 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QT63 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QT63 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QT63 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QT63 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QT63 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QT63 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QT63 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QT63 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QT63 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QT63 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QT63 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QT63 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QT63 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QT63 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QT63 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QT63 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QT63 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QT63 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QT63 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QT63 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QT63 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QT63 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QT63 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QT63 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QT63 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QT63 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QT63 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QT63 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QT63 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QT63 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QT63 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QT63 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QT63 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QT63 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QT63 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QT63 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QT63 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QT63 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QT63 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QT63 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QT63 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QT63 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QT63 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QT63 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QT63 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QT63 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QT63 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QT63 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QT63 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QT63 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QT63 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QT63 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QT63 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QT63 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QT63 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
J3QT63 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QT63 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QT63 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QT63 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QT63 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QT63 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QT63 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QT63 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms