Protein–RNA interactions for Protein: E9PQR5

NPIPB8, Nuclear pore complex-interacting protein family member B8, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB8E9PQR5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPB8E9PQR5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPB8E9PQR5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms