Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
B4E171 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
B4E171 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
B4E171 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
B4E171 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
B4E171 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
B4E171 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
B4E171 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
B4E171 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
B4E171 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
B4E171 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
B4E171 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
B4E171 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
B4E171 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
B4E171 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
B4E171 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
B4E171 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
B4E171 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
B4E171 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
B4E171 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
B4E171 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
B4E171 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
B4E171 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
B4E171 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
B4E171 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
B4E171 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
B4E171 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
B4E171 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
B4E171 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
B4E171 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B4E171 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B4E171 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B4E171 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B4E171 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B4E171 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B4E171 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
B4E171 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
B4E171 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B4E171 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
B4E171 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
B4E171 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
B4E171 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
B4E171 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
B4E171 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
B4E171 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
B4E171 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
B4E171 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
B4E171 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B4E171 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B4E171 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B4E171 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
B4E171 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
B4E171 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B4E171 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B4E171 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B4E171 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
B4E171 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
B4E171 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B4E171 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B4E171 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B4E171 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
B4E171 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
B4E171 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
B4E171 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
B4E171 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
B4E171 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
B4E171 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
B4E171 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
B4E171 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
B4E171 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B4E171 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
B4E171 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
B4E171 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
B4E171 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
B4E171 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
B4E171 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
B4E171 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
B4E171 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
B4E171 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B4E171 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B4E171 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B4E171 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
B4E171 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
B4E171 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
B4E171 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
B4E171 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
B4E171 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
B4E171 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
B4E171 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
B4E171 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
B4E171 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B4E171 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B4E171 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B4E171 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
B4E171 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
B4E171 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
B4E171 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
B4E171 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
B4E171 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B4E171 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms