Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA8JA6NMD2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA8JA6NMD2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA8JA6NMD2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA8JA6NMD2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA8JA6NMD2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA8JA6NMD2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA8JA6NMD2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA8JA6NMD2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA8JA6NMD2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA8JA6NMD2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA8JA6NMD2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA8JA6NMD2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA8JA6NMD2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA8JA6NMD2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA8JA6NMD2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA8JA6NMD2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA8JA6NMD2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA8JA6NMD2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA8JA6NMD2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms