Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN8A6NHC0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms