Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERINC4A6NH21 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SERINC4A6NH21 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SERINC4A6NH21 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERINC4A6NH21 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERINC4A6NH21 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERINC4A6NH21 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERINC4A6NH21 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERINC4A6NH21 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERINC4A6NH21 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERINC4A6NH21 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SERINC4A6NH21 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERINC4A6NH21 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERINC4A6NH21 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERINC4A6NH21 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SERINC4A6NH21 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERINC4A6NH21 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SERINC4A6NH21 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERINC4A6NH21 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERINC4A6NH21 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERINC4A6NH21 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERINC4A6NH21 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERINC4A6NH21 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERINC4A6NH21 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERINC4A6NH21 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERINC4A6NH21 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SERINC4A6NH21 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERINC4A6NH21 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERINC4A6NH21 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERINC4A6NH21 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERINC4A6NH21 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SERINC4A6NH21 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERINC4A6NH21 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms