Protein–RNA interactions for Protein: A6NGJ6

TRIM64, Tripartite motif-containing protein 64, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM64A6NGJ6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM64A6NGJ6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM64A6NGJ6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM64A6NGJ6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM64A6NGJ6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM64A6NGJ6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM64A6NGJ6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM64A6NGJ6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM64A6NGJ6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms