Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB9

WIPF3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPF3A6NGB9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
WIPF3A6NGB9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WIPF3A6NGB9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WIPF3A6NGB9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WIPF3A6NGB9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WIPF3A6NGB9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WIPF3A6NGB9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WIPF3A6NGB9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
WIPF3A6NGB9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
WIPF3A6NGB9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
WIPF3A6NGB9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms