Protein–RNA interactions for Protein: A5YKK6

CNOT1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT1A5YKK6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CNOT1A5YKK6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms