Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PSDA5PKW4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PSDA5PKW4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
PSDA5PKW4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PSDA5PKW4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PSDA5PKW4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PSDA5PKW4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PSDA5PKW4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PSDA5PKW4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PSDA5PKW4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PSDA5PKW4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PSDA5PKW4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PSDA5PKW4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PSDA5PKW4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PSDA5PKW4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PSDA5PKW4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PSDA5PKW4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PSDA5PKW4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
PSDA5PKW4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PSDA5PKW4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PSDA5PKW4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PSDA5PKW4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PSDA5PKW4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PSDA5PKW4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PSDA5PKW4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PSDA5PKW4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
PSDA5PKW4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PSDA5PKW4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PSDA5PKW4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PSDA5PKW4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
PSDA5PKW4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
PSDA5PKW4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PSDA5PKW4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PSDA5PKW4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PSDA5PKW4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PSDA5PKW4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
PSDA5PKW4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PSDA5PKW4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PSDA5PKW4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
PSDA5PKW4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
PSDA5PKW4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PSDA5PKW4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PSDA5PKW4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PSDA5PKW4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PSDA5PKW4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
PSDA5PKW4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PSDA5PKW4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PSDA5PKW4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PSDA5PKW4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PSDA5PKW4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PSDA5PKW4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PSDA5PKW4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PSDA5PKW4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PSDA5PKW4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PSDA5PKW4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PSDA5PKW4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PSDA5PKW4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PSDA5PKW4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PSDA5PKW4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PSDA5PKW4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PSDA5PKW4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PSDA5PKW4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PSDA5PKW4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PSDA5PKW4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PSDA5PKW4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PSDA5PKW4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PSDA5PKW4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PSDA5PKW4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PSDA5PKW4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PSDA5PKW4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PSDA5PKW4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
PSDA5PKW4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PSDA5PKW4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PSDA5PKW4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PSDA5PKW4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PSDA5PKW4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PSDA5PKW4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PSDA5PKW4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PSDA5PKW4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PSDA5PKW4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PSDA5PKW4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PSDA5PKW4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PSDA5PKW4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PSDA5PKW4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PSDA5PKW4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PSDA5PKW4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PSDA5PKW4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PSDA5PKW4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PSDA5PKW4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PSDA5PKW4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PSDA5PKW4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PSDA5PKW4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PSDA5PKW4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PSDA5PKW4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PSDA5PKW4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PSDA5PKW4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PSDA5PKW4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PSDA5PKW4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PSDA5PKW4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PSDA5PKW4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms