Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRAMEF22A3QJZ6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
PRAMEF22A3QJZ6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms