Protein–RNA interactions for Protein: A0A578

TCRBV5S1A1T, T-cell receptor beta variable 5-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S1A1TA0A578 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCRBV5S1A1TA0A578 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCRBV5S1A1TA0A578 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TCRBV5S1A1TA0A578 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TCRBV5S1A1TA0A578 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCRBV5S1A1TA0A578 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCRBV5S1A1TA0A578 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCRBV5S1A1TA0A578 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCRBV5S1A1TA0A578 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TCRBV5S1A1TA0A578 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCRBV5S1A1TA0A578 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCRBV5S1A1TA0A578 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCRBV5S1A1TA0A578 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCRBV5S1A1TA0A578 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCRBV5S1A1TA0A578 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCRBV5S1A1TA0A578 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCRBV5S1A1TA0A578 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCRBV5S1A1TA0A578 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCRBV5S1A1TA0A578 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCRBV5S1A1TA0A578 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCRBV5S1A1TA0A578 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCRBV5S1A1TA0A578 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCRBV5S1A1TA0A578 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCRBV5S1A1TA0A578 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCRBV5S1A1TA0A578 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TCRBV5S1A1TA0A578 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCRBV5S1A1TA0A578 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCRBV5S1A1TA0A578 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCRBV5S1A1TA0A578 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
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