Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1W7

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5A0A0B4J1W7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPA5A0A0B4J1W7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NPIPA5A0A0B4J1W7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPIPA5A0A0B4J1W7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPIPA5A0A0B4J1W7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPIPA5A0A0B4J1W7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.2 ms