Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6F4

TRBV21OR9-2, T-cell receptor beta variable 21/OR9-2 (pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
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