Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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SH3BP1Q9Y3L3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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