Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y9

KLF13, Krueppel-like factor 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF13Q9Y2Y9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLF13Q9Y2Y9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF13Q9Y2Y9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF13Q9Y2Y9 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLF13Q9Y2Y9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLF13Q9Y2Y9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLF13Q9Y2Y9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLF13Q9Y2Y9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLF13Q9Y2Y9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF13Q9Y2Y9 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF13Q9Y2Y9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF13Q9Y2Y9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLF13Q9Y2Y9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF13Q9Y2Y9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF13Q9Y2Y9 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLF13Q9Y2Y9 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF13Q9Y2Y9 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLF13Q9Y2Y9 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLF13Q9Y2Y9 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms