Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD1BQ9UPS6 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms