Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms