Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
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