Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2IRD1Q9UHL9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms