Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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