Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC2Q9C0B9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms