Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms