Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms