Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PI4K2AQ9BTU6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PI4K2AQ9BTU6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PI4K2AQ9BTU6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PI4K2AQ9BTU6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PI4K2AQ9BTU6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PI4K2AQ9BTU6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PI4K2AQ9BTU6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PI4K2AQ9BTU6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PI4K2AQ9BTU6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PI4K2AQ9BTU6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PI4K2AQ9BTU6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4K2AQ9BTU6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4K2AQ9BTU6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4K2AQ9BTU6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4K2AQ9BTU6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4K2AQ9BTU6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4K2AQ9BTU6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4K2AQ9BTU6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4K2AQ9BTU6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4K2AQ9BTU6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4K2AQ9BTU6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4K2AQ9BTU6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms