Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMCHL2Q9BQD1 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms