Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX18Q96RF0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms