Protein–RNA interactions for Protein: Q96AH8

RAB7B, Ras-related protein Rab-7b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7BQ96AH8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB7BQ96AH8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms