Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms