Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.05■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FNDC9Q8TBE3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms