Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4DQ86TL0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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