Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2AFVQ71UI9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2AFVQ71UI9 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2AFVQ71UI9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2AFVQ71UI9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2AFVQ71UI9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2AFVQ71UI9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2AFVQ71UI9 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2AFVQ71UI9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2AFVQ71UI9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2AFVQ71UI9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2AFVQ71UI9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2AFVQ71UI9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2AFVQ71UI9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2AFVQ71UI9 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2AFVQ71UI9 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2AFVQ71UI9 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2AFVQ71UI9 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2AFVQ71UI9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2AFVQ71UI9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2AFVQ71UI9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2AFVQ71UI9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2AFVQ71UI9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2AFVQ71UI9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms