Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms