Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms