Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms