Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms