Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
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COL24A1Q17RW2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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COL24A1Q17RW2 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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COL24A1Q17RW2 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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COL24A1Q17RW2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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COL24A1Q17RW2 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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COL24A1Q17RW2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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COL24A1Q17RW2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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COL24A1Q17RW2 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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