Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms