Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SNAPC1Q16533 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SNAPC1Q16533 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SNAPC1Q16533 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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