Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms