Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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