Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
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