Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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