Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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