Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
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ITGA9Q13797 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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ITGA9Q13797 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGA9Q13797 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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ITGA9Q13797 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA9Q13797 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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ITGA9Q13797 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA9Q13797 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA9Q13797 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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ITGA9Q13797 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA9Q13797 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA9Q13797 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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ITGA9Q13797 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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ITGA9Q13797 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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ITGA9Q13797 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA9Q13797 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA9Q13797 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA9Q13797 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA9Q13797 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA9Q13797 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA9Q13797 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA9Q13797 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA9Q13797 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA9Q13797 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA9Q13797 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA9Q13797 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA9Q13797 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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