Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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