Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms