Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
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